1958年成立福州农学院农业机械系，设置农业机械本科专业；
1969年福建农学院被撤销；
1972年复办的福建农学院设置了农业机械化专科专业；
1973年停招一年；
1974年恢复招生，并增设了农村水电专科和拖拉机维修专科专业；
1975年农业机械化专科改名为农业机械设计制造专科；
1976年恢复本科招生，专业名称为农业机械设计与制造，同时保留拖拉机维修专科，取消农业机械化专科和农村水电专科的招生；
1977年按农业机械本科和农业机械化专科专业招生，取消拖拉机维修专科招生；
1978年至1983年仅有农业机械本科招生；
1984年开始增设农村能源及电气化专科专业；
1985年开始增设汽车与拖拉机本科专业；
1987年农业机械系更名为农业工程系；
1989年农业机械专业改名为机械设计与制造专业；
1993年农业工程系改名为机电工程系，同时增设汽车运用与维修专科专业；
1994年获批设立农业机械化工程二级学科硕士点，同年农村能源及电气化专科改名为工业企业电气化专科专业；
1999年和2000年增设了农业机械化及其自动化本科专业（仅招生两届）；
2000年10月福建农业大学与福建林学院两校合并后机电工程系改名为太阳集团电子游戏，机械设计与制造本科更名为机械设计制造及其自动化本科，将汽车与拖拉机专业合并为机械设计制造及其自动化（汽车与拖拉机方向），工业企业电气化专科改名为电气工程及其自动化本科专业；
2001年获批设立机械设计及理论二级学科硕士点；
2002年增设电子科学与技术本科专业；
2003年增设WEB应用程序设计和数据库管理等两个软件高职专业；
2005年增设工业工程本科专业；
2006年获批农业工程一级学科硕士点，并从当年开始停办所有专科专业；
2007年机械设计制造及其自动化（汽车与拖拉机方向）更名为车辆工程本科专业；
2011年获批机械工程一级学科硕士点；
2013年恢复农业机械化及其自动化本科专业招生；
2018年3月获批农业工程一级学科博士点。
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